Исполнительный совет Центристской партии Эстонии руководит деятельностью партии на основе программы партии и направлений деятельности, утвержденных съездом и Советом.
В состав Исполнительного комитета партии входят: председатель, избираемый на съезде; четырнадцать членов Исполнительного комитета, избираемых на съезде; председатель Совета партии; председатель парламентской группы Центральной партии в Рийгикогу; председатель Молодежного совета партии.
Исполнительный комитет партии собирается не реже одного раза в месяц. Работой партийного бюро руководит председатель партии.